scaffold23466 Repeat List
| genome |
start |
end |
strand |
repeat-name |
repeat-class |
| scaffold23466 |
1 |
368 |
- |
RS3569 |
Unspecified |
| scaffold23466 |
1 |
325 |
- |
RS520 |
Unspecified |
| scaffold23466 |
152 |
538 |
- |
RS520 |
Unspecified |
| scaffold23466 |
468 |
754 |
+ |
RS13405 |
Unspecified |
| scaffold23466 |
525 |
753 |
- |
RS10269 |
Unspecified |
| scaffold23466 |
803 |
838 |
+ |
(TAA)n |
Simple_repeat |
| scaffold23466 |
1696 |
1861 |
+ |
(ATC)n |
Simple_repeat |
| scaffold23466 |
1794 |
1812 |
+ |
(A)n |
Simple_repeat |
| scaffold23466 |
2329 |
2362 |
+ |
(TGATTGC)n |
Simple_repeat |
| scaffold23466 |
3544 |
3600 |
+ |
(TTG)n |
Simple_repeat |
| scaffold23466 |
3601 |
3621 |
+ |
(GTG)n |
Simple_repeat |
| scaffold23466 |
3622 |
3654 |
+ |
(GT)n |
Simple_repeat |
| scaffold23466 |
4020 |
4194 |
+ |
RS3441 |
Unspecified |
| scaffold23466 |
4178 |
4372 |
- |
RS3212 |
Unspecified |
| scaffold23466 |
4489 |
4524 |
+ |
(TTATT)n |
Simple_repeat |
| scaffold23466 |
4555 |
4593 |
+ |
A-rich |
Low_complexity |
| scaffold23466 |
4789 |
4957 |
+ |
RS17160 |
Unspecified |
| scaffold23466 |
5218 |
5616 |
+ |
RS1900 |
Unspecified |
| scaffold23466 |
5931 |
5960 |
+ |
GA-rich |
Low_complexity |
| scaffold23466 |
6313 |
6346 |
+ |
(GGACTA)n |
Simple_repeat |
| scaffold23466 |
6746 |
6782 |
+ |
A-rich |
Low_complexity |
| scaffold23466 |
7318 |
7384 |
+ |
(TTTCTTT)n |
Simple_repeat |
| scaffold23466 |
8085 |
8132 |
+ |
(TGAAAAA)n |
Simple_repeat |
| scaffold23466 |
10583 |
10616 |
+ |
(GGACTA)n |
Simple_repeat |
| scaffold23466 |
11103 |
11192 |
- |
RS488 |
Unspecified |
| scaffold23466 |
11191 |
11409 |
- |
PL600 |
Unspecified |
| scaffold23466 |
11952 |
12000 |
+ |
(TATT)n |
Simple_repeat |
| scaffold23466 |
12036 |
12094 |
+ |
(TGGATGA)n |
Simple_repeat |
| scaffold23466 |
12137 |
12183 |
+ |
(TTA)n |
Simple_repeat |
| scaffold23466 |
12753 |
12801 |
+ |
(TATT)n |
Simple_repeat |
| scaffold23466 |
12939 |
12970 |
+ |
(TTA)n |
Simple_repeat |
| scaffold23466 |
13427 |
13485 |
+ |
(A)n |
Simple_repeat |
| scaffold23466 |
13631 |
13691 |
+ |
(TGGATGA)n |
Simple_repeat |
| scaffold23466 |
13732 |
13778 |
+ |
(TTA)n |
Simple_repeat |
| scaffold23466 |
14384 |
14520 |
- |
PL737 |
Unspecified |
| scaffold23466 |
15011 |
15166 |
- |
PL293 |
Unspecified |
| scaffold23466 |
15193 |
15978 |
+ |
RS3524 |
Unspecified |
| scaffold23466 |
15984 |
16044 |
+ |
(TGGATGA)n |
Simple_repeat |
| scaffold23466 |
16238 |
16267 |
+ |
(T)n |
Simple_repeat |
| scaffold23466 |
16483 |
16516 |
+ |
A-rich |
Low_complexity |
| scaffold23466 |
16710 |
16757 |
+ |
(TATT)n |
Simple_repeat |
| scaffold23466 |
16884 |
16919 |
+ |
(GTT)n |
Simple_repeat |
| scaffold23466 |
17449 |
17476 |
+ |
(ATTT)n |
Simple_repeat |
| scaffold23466 |
17630 |
17722 |
- |
RS15470 |
Unspecified |
| scaffold23466 |
17919 |
18080 |
+ |
RS5 |
Unspecified |
| scaffold23466 |
18245 |
18293 |
+ |
(TC)n |
Simple_repeat |
| scaffold23466 |
18293 |
18325 |
+ |
(T)n |
Simple_repeat |
| scaffold23466 |
18294 |
18326 |
+ |
(TTCT)n |
Simple_repeat |
| scaffold23466 |
18327 |
18368 |
+ |
A-rich |
Low_complexity |
| scaffold23466 |
18550 |
18629 |
+ |
(T)n |
Simple_repeat |
| scaffold23466 |
19232 |
19274 |
+ |
(T)n |
Simple_repeat |
| scaffold23466 |
21071 |
21087 |
+ |
(A)n |
Simple_repeat |
| scaffold23466 |
27571 |
27616 |
+ |
(CAGCCC)n |
Simple_repeat |
| scaffold23466 |
32682 |
32811 |
+ |
(A)n |
Simple_repeat |
| scaffold23466 |
32788 |
32811 |
+ |
(A)n |
Simple_repeat |
| scaffold23466 |
33194 |
33223 |
+ |
(CTCTTCA)n |
Simple_repeat |
| scaffold23466 |
33357 |
34192 |
- |
RS319 |
Unspecified |
| scaffold23466 |
34159 |
34324 |
- |
RS319 |
Unspecified |
| scaffold23466 |
34260 |
34494 |
- |
RS1527 |
Unspecified |
| scaffold23466 |
34569 |
34598 |
+ |
(ACCCGA)n |
Simple_repeat |
| scaffold23466 |
35130 |
35153 |
+ |
(T)n |
Simple_repeat |
| scaffold23466 |
35483 |
35513 |
+ |
(A)n |
Simple_repeat |
| scaffold23466 |
35673 |
35834 |
- |
RS1527 |
Unspecified |
| scaffold23466 |
36275 |
36304 |
+ |
(CTTT)n |
Simple_repeat |
| scaffold23466 |
36358 |
36422 |
+ |
A-rich |
Low_complexity |
| scaffold23466 |
36708 |
36745 |
+ |
(ATACAAT)n |
Simple_repeat |
| scaffold23466 |
36746 |
36767 |
+ |
A-rich |
Low_complexity |
| scaffold23466 |
36790 |
36882 |
+ |
(ATT)n |
Simple_repeat |
| scaffold23466 |
37237 |
37520 |
+ |
RS96 |
Unspecified |
| scaffold23466 |
37527 |
37694 |
+ |
RS1292 |
Unspecified |
| scaffold23466 |
37835 |
37852 |
+ |
(T)n |
Simple_repeat |
| scaffold23466 |
38374 |
38574 |
+ |
RS5771 |
Unspecified |
| scaffold23466 |
38698 |
38869 |
+ |
RS42 |
Unspecified |
| scaffold23466 |
39439 |
39472 |
+ |
(AATTTA)n |
Simple_repeat |
| scaffold23466 |
41273 |
41457 |
+ |
RS7386 |
Unspecified |
| scaffold23466 |
41545 |
41648 |
+ |
COPMET_LTR |
LTR/Copia |
| scaffold23466 |
42304 |
42348 |
+ |
(AATG)n |
Simple_repeat |
| scaffold23466 |
42442 |
43416 |
- |
Copia-12_ST-I |
LTR/Copia |
| scaffold23466 |
45625 |
45691 |
+ |
(GTGCTT)n |
Simple_repeat |