scaffold27808 Repeat List
| genome |
start |
end |
strand |
repeat-name |
repeat-class |
| scaffold27808 |
158 |
189 |
+ |
(TGAA)n |
Simple_repeat |
| scaffold27808 |
870 |
899 |
+ |
(CTTT)n |
Simple_repeat |
| scaffold27808 |
1181 |
1359 |
+ |
RS599 |
Unspecified |
| scaffold27808 |
1522 |
1600 |
+ |
(ATA)n |
Simple_repeat |
| scaffold27808 |
1608 |
1657 |
+ |
(GCAAT)n |
Simple_repeat |
| scaffold27808 |
2083 |
2119 |
+ |
(TTACCA)n |
Simple_repeat |
| scaffold27808 |
6922 |
6946 |
+ |
(T)n |
Simple_repeat |
| scaffold27808 |
7098 |
7182 |
+ |
(TTCAG)n |
Simple_repeat |
| scaffold27808 |
7828 |
7984 |
+ |
(GAGCAA)n |
Simple_repeat |
| scaffold27808 |
9745 |
9821 |
- |
RS509 |
Unspecified |
| scaffold27808 |
9823 |
10012 |
+ |
RS509 |
Unspecified |
| scaffold27808 |
9843 |
10012 |
+ |
RS2719 |
Unspecified |
| scaffold27808 |
10194 |
10274 |
+ |
(A)n |
Simple_repeat |
| scaffold27808 |
10194 |
10239 |
+ |
(A)n |
Simple_repeat |
| scaffold27808 |
10225 |
10274 |
+ |
RS5279 |
Unspecified |
| scaffold27808 |
10284 |
10330 |
+ |
RS5279 |
Unspecified |
| scaffold27808 |
10335 |
10372 |
+ |
(A)n |
Simple_repeat |
| scaffold27808 |
10383 |
10465 |
- |
RS5279 |
Unspecified |
| scaffold27808 |
10452 |
10625 |
+ |
RS275 |
Unspecified |
| scaffold27808 |
10841 |
10872 |
+ |
A-rich |
Low_complexity |
| scaffold27808 |
11244 |
11281 |
+ |
A-rich |
Low_complexity |
| scaffold27808 |
11452 |
11496 |
+ |
(TTAATTT)n |
Simple_repeat |
| scaffold27808 |
11497 |
11562 |
+ |
(A)n |
Simple_repeat |
| scaffold27808 |
11629 |
11743 |
- |
RS11606 |
Unspecified |
| scaffold27808 |
11770 |
11808 |
+ |
(TTATA)n |
Simple_repeat |
| scaffold27808 |
12247 |
12286 |
+ |
(TCTT)n |
Simple_repeat |
| scaffold27808 |
15154 |
15300 |
+ |
MuDR-6_Mad |
DNA/MULE-MuDR |
| scaffold27808 |
15733 |
15754 |
+ |
(GAT)n |
Simple_repeat |
| scaffold27808 |
15798 |
15819 |
+ |
(CTG)n |
Simple_repeat |
| scaffold27808 |
16315 |
16508 |
+ |
PL699 |
Unspecified |
| scaffold27808 |
16917 |
16970 |
+ |
(TTAATTT)n |
Simple_repeat |
| scaffold27808 |
17434 |
17463 |
+ |
(AATG)n |
Simple_repeat |
| scaffold27808 |
18217 |
18246 |
+ |
(CTTT)n |
Simple_repeat |
| scaffold27808 |
18887 |
18911 |
+ |
(ATA)n |
Simple_repeat |
| scaffold27808 |
18922 |
19007 |
+ |
(CAATG)n |
Simple_repeat |
| scaffold27808 |
19665 |
19703 |
+ |
(AAGGGT)n |
Simple_repeat |
| scaffold27808 |
24009 |
24029 |
+ |
(ATC)n |
Simple_repeat |
| scaffold27808 |
26958 |
26985 |
+ |
A-rich |
Low_complexity |
| scaffold27808 |
27466 |
27550 |
+ |
Copia-3_PTri-I |
LTR/Copia |
| scaffold27808 |
27551 |
27765 |
+ |
Copia-3_PTri-I |
LTR/Copia |
| scaffold27808 |
28038 |
28134 |
+ |
RS14441 |
Unspecified |
| scaffold27808 |
28719 |
28762 |
+ |
(AACTG)n |
Simple_repeat |
| scaffold27808 |
28885 |
28929 |
+ |
(TCAACAG)n |
Simple_repeat |
| scaffold27808 |
30179 |
30197 |
+ |
(T)n |
Simple_repeat |
| scaffold27808 |
31592 |
31651 |
+ |
GA-rich |
Low_complexity |
| scaffold27808 |
33619 |
33800 |
- |
RS178 |
Unspecified |
| scaffold27808 |
34603 |
34658 |
+ |
Copia-3_PTri-I |
LTR/Copia |
| scaffold27808 |
34659 |
34676 |
+ |
(A)n |
Simple_repeat |
| scaffold27808 |
34832 |
34884 |
+ |
(ATCA)n |
Simple_repeat |
| scaffold27808 |
34986 |
35045 |
+ |
A-rich |
Low_complexity |
| scaffold27808 |
38365 |
38405 |
+ |
A-rich |
Low_complexity |
| scaffold27808 |
41959 |
41989 |
+ |
(AACAA)n |
Simple_repeat |
| scaffold27808 |
43620 |
43654 |
+ |
A-rich |
Low_complexity |
| scaffold27808 |
49160 |
49192 |
+ |
(TCAAT)n |
Simple_repeat |
| scaffold27808 |
49935 |
50049 |
+ |
RS4475 |
Unspecified |
| scaffold27808 |
50752 |
50773 |
+ |
(AGC)n |
Simple_repeat |
| scaffold27808 |
50854 |
50877 |
+ |
(TTCC)n |
Simple_repeat |
| scaffold27808 |
52118 |
52182 |
+ |
RS65 |
Unspecified |
| scaffold27808 |
55179 |
55201 |
+ |
(T)n |
Simple_repeat |
| scaffold27808 |
55179 |
55305 |
+ |
(T)n |
Simple_repeat |
| scaffold27808 |
55193 |
55305 |
+ |
RS8239 |
Unspecified |
| scaffold27808 |
55630 |
55752 |
+ |
RS12983 |
Unspecified |
| scaffold27808 |
55807 |
55929 |
+ |
RS12983 |
Unspecified |
| scaffold27808 |
58369 |
58639 |
+ |
RS10014 |
Unspecified |
| scaffold27808 |
59497 |
59525 |
+ |
(AACA)n |
Simple_repeat |
| scaffold27808 |
59526 |
59533 |
+ |
(CAA)n |
Simple_repeat |
| scaffold27808 |
60058 |
60113 |
+ |
(TTAT)n |
Simple_repeat |
| scaffold27808 |
60177 |
60309 |
+ |
(AATTG)n |
Simple_repeat |
| scaffold27808 |
60612 |
60635 |
+ |
(TAA)n |
Simple_repeat |
| scaffold27808 |
61345 |
61615 |
+ |
RS10014 |
Unspecified |
| scaffold27808 |
61840 |
61941 |
+ |
RS4475 |
Unspecified |
| scaffold27808 |
62554 |
63006 |
- |
PL75 |
Unspecified |
| scaffold27808 |
64535 |
64646 |
+ |
RS8239 |
Unspecified |
| scaffold27808 |
64977 |
65099 |
+ |
RS12983 |
Unspecified |
| scaffold27808 |
65750 |
65800 |
- |
Copia10-VV_LTR |
LTR/Copia |
| scaffold27808 |
66741 |
66968 |
- |
RS9457 |
Unspecified |
| scaffold27808 |
66965 |
67175 |
+ |
RS12703 |
Unspecified |
| scaffold27808 |
67270 |
67306 |
+ |
(TAA)n |
Simple_repeat |
| scaffold27808 |
68423 |
68451 |
+ |
(AACAG)n |
Simple_repeat |
| scaffold27808 |
72937 |
72982 |
+ |
(TACTTT)n |
Simple_repeat |
| scaffold27808 |
77074 |
77170 |
- |
RS15482 |
Unspecified |
| scaffold27808 |
78560 |
78596 |
+ |
(AAC)n |
Simple_repeat |
| scaffold27808 |
78698 |
78753 |
+ |
(ATC)n |
Simple_repeat |
| scaffold27808 |
78762 |
78802 |
+ |
(CTA)n |
Simple_repeat |
| scaffold27808 |
79258 |
79301 |
+ |
(T)n |
Simple_repeat |
| scaffold27808 |
79349 |
79401 |
+ |
(TAT)n |
Simple_repeat |
| scaffold27808 |
80381 |
80402 |
+ |
(A)n |
Simple_repeat |
| scaffold27808 |
82524 |
82698 |
+ |
(A)n |
Simple_repeat |
| scaffold27808 |
82524 |
82542 |
+ |
(A)n |
Simple_repeat |